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      1. 外泌體研究

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        外泌體全轉錄組測序服務

        華盈生物推出的外泌體全轉錄組測序服務,不僅可以進行深入的基因功能注釋,而且還能夠分析到外泌體可能來源的細胞類型及占比(外泌體溯源),對于深入了解不同發育階段或疾病狀態背后的外泌體調控機制具有十分重要的意義。
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        產品描述

               外泌體中攜帶有來自母本細胞的多種蛋白質、脂類、RNA等重要信息。對外泌體中的長鏈RNAs進行全轉錄組測序分析,一次測序實驗,即可以獲得上萬條長鏈RNAs的檢測數據,全面覆蓋 mRNA、lncRNA和 circRNA等長鏈RNAs。外泌體全轉錄組測序數據量大、信息全面,是發現特異性疾病診斷標志物、進行多組學分析的重要手段。同時,由于外泌體攜帶的長鏈RNAs中有超過70%為mRNA,外泌體全轉錄組測序的結果不僅可以進行深入的基因功能注釋,而且還能夠分析到外泌體可能來源的細胞類型及占比(即外泌體溯源)。

         
         
         

         

        |   華盈生物全轉錄組測序服務

               華盈生物外泌體全轉錄組測序服務體系,充分結合了專利微量核酸建庫技術、NGS技術和全新的生物信息序列比對算法,可對血漿中外泌體的mRNA、lncRNA和circRNA 等RNAs進行充分捕獲和測序,可以實現從1mL血漿分離的外泌體中,穩定檢出超過1萬條長鏈RNAs。

        |   分析內容

        |   經典案例:血漿外泌體全轉錄組篩選胰腺癌標志物發現

               2020年,復旦大學附屬腫瘤醫院研究團隊從1mL血漿中分離外泌體,利用專利建庫技術進行全轉錄組測序,成功篩選到了8種長鏈RNA,其形成的胰腺癌診斷標志物組合,比傳統的CA19-9更加靈敏和特異。

               外泌體全轉錄組測序結果顯示:入組人群血漿外泌體中的mRNA普遍富集度最高,其次是LncRNA。隨機森林等數據分析發現8種長鏈RNA在PDAC患者中普遍高于CP和HC組,可作為潛在診斷標志物。由8種長鏈RNA組成的標志物組合d-signature對于Ⅰ和Ⅱ期胰腺導管腺癌的診斷效能AUC 達到0.949, 遠高于經典標志物CA19 -9 。聯合d-signature和CA19-9診斷時,診斷效能進一步提高到AUC=0.964。

         

        |   華盈優勢

        1. 一站式服務體系:

        客戶只需提供血漿樣本,華盈生物為您完成從樣品準備,文庫制備,上機測序到數據分析整套服務流程。

        2.專利建庫技術:

        華盈生物采用的專利微量核酸建庫技術,可對僅1mL血漿中提取的外泌體RNA進行建庫和測序分析。

        3.專業生物信息分析:

        華盈生物具有強大的生物信息學團隊,能夠滿足客戶的各類深入數據分析要求,相關分析示例如下:

         

         相關文獻

        [1]. Xihao Du, Qingli Zhang, Yixuan Jiang, et al. Dynamic molecular choreography induced by traffic exposure: A randomized, crossover trial using multi-omics profiling. J Hazard Mater. 2022 Feb 15;424(Pt A):127359. IF=10.588

        [2]Jin Ji, Rui Chen, Lin Zhao, et al. Circulating exosomal mRNA profiling identifies novel signatures for the detection of prostate cancer. Mol Cancer. 2021 Mar 30;20(1):58. IF=27.401

        [3]. Chu-Wen Chen, Min Fu, Zhi-Hao Du, et al. Long Noncoding RNA MRPL23-AS1 Promoteoid Cystic Carcinoma Lung Metastasis. Cancer Res. 2020 Jun 1;80(11):2273-2285. IF=12.479

        [4]Shulin Yu, Yuchen Li, Zhuan Liao, et al. Plasma extracellular vesicle long RNA profiling identifies a diagnostic signature for the detection of pancreatic ductal adenocarcinoma]. Gut, 2019, 69(3):gutjnl-2019-318860. IF=23.059

        [5]Yuchen Li, Jingjing Zhao, Shulin Yu, et al. Extracellular Vesicles Long RNA Sequencing Reveals Abundant mRNA, circRNA, and lncRNA in Human Blood as Potential Biomarkers for Cancer Diagnosis. Clin Chem. 2019 Jun;65(6):798-808. IF=8.327

        關鍵詞:
        全轉錄組測序
        華盈生物
        外泌體研究
        mRNA
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        戰略合作

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        發布時間:2021-08-11 17:21:10

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